知网查重不科学的原因主要包括：1.算法不够智能，无法准确识别同义词和改写句子；2.对中文语境理解不足，容易产生误判；3.容易被篡改绕过检测。解决方法可以从优化算法、提高语境识别能力、加强篡改检测等方面入手，提高查重准确性。

此外，知网查重过程中存在的局限性也是导致不科学的重要原因。例如，无法识别图片、视频等非文本形式的抄袭，也无法完全避免自我抄袭等问题。因此，除了依赖查重工具，学术诚信和自觉抵制抄袭行为同样至关重要。